丙型肝炎是一種主要經(jīng)血液傳播、由丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus, HCV)感染引起的疾病。HCV慢性感染可導(dǎo)致肝臟慢性炎癥、壞死和纖維化,部分患者可發(fā)展為肝硬化甚至肝細(xì)胞癌(HCC),對(duì)患者的健康和生命危害極大,已成為嚴(yán)重的社會(huì)和公共衛(wèi)生問(wèn)題。
HCV是一種RNA病毒,其核酸是單股、線性、正鏈RNA。由于HCV RNA復(fù)制所依賴的聚合酶缺乏校正功能,HCV基因組呈現(xiàn)高度異質(zhì)性,目前可分為6個(gè)基因型及不同亞型,按照國(guó)際通行的方法,以阿拉伯?dāng)?shù)字表示HCV基因型,以小寫(xiě)的英文字母表示基因亞型(如1b、2a、3b等)。不同HCV基因型感染者的臨床表現(xiàn)、肝病嚴(yán)重程度及慢性化病程進(jìn)展均有差異,抗病毒治療的方案和效果也不同。因此檢測(cè)HCV基因型有助于指導(dǎo)判斷治療的難易程度、轉(zhuǎn)歸和制定個(gè)體化抗病毒治療方案。
本試劑盒針對(duì)HCV-RNA基因組,設(shè)計(jì)特異性引物和探針,采用一步法RT-PCR體外擴(kuò)增法結(jié)合熒光探針檢測(cè)技術(shù),檢測(cè)中國(guó)國(guó)內(nèi)人丙型肝炎病毒(HCV)常見(jiàn)基因型別1b、2a、3a、3b和6a。
一步法RT-PCR即逆轉(zhuǎn)錄和PCR在一個(gè)共同的體系中進(jìn)行。一步法RT-PCR在處理大量樣品時(shí)易于操作,因?yàn)樵赾DNA合成和擴(kuò)增之間不需要打開(kāi)管蓋,有助于減少殘余污染,簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)操作步驟。而且,一步法RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄所得的cDNA全部用于PCR擴(kuò)增,故可以得到更高的靈敏度。基于以上特點(diǎn),一步法RT-PCR在臨床檢測(cè)應(yīng)用中將有顯著的優(yōu)勢(shì)。
熒光PCR技術(shù)在引物特異的基礎(chǔ)上采用模版序列特異的熒光探針從而進(jìn)一步提高的檢測(cè)信號(hào)的特異性;反應(yīng)中每擴(kuò)增一個(gè)特異產(chǎn)物只釋放一個(gè)分子的熒光染料,儀器檢測(cè)的是特異擴(kuò)增的結(jié)果,非特異產(chǎn)物對(duì)檢測(cè)信號(hào)沒(méi)有影響,有效提高檢測(cè)的專一性。有多種不同波長(zhǎng)的熒光基團(tuán)對(duì)可供選擇,使得熒光PCR技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)在同一管內(nèi)檢測(cè)多個(gè)基因位點(diǎn),降低成本也提高效率和準(zhǔn)確性。本項(xiàng)目恰好充分利用了熒光PCR技術(shù)的優(yōu)點(diǎn),針對(duì)HCV常見(jiàn)基因型設(shè)計(jì)型特異探針,各探針標(biāo)記不同的熒光染料,在不同波長(zhǎng)檢測(cè),從而達(dá)到分型的目的。