丙型肝炎是一種主要經(jīng)血液傳播、由丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus, HCV)感染引起的疾病。HCV慢性感染可導(dǎo)致肝臟慢性炎癥、壞死和纖維化,部分患者可發(fā)展為肝硬化甚至肝細(xì)胞癌(HCC),對患者的健康和生命危害極大,已成為嚴(yán)重的社會和公共衛(wèi)生問題。
HCV是一種RNA病毒,其核酸是單股、線性、正鏈RNA。由于HCV RNA復(fù)制所依賴的聚合酶缺乏校正功能,HCV基因組呈現(xiàn)高度異質(zhì)性,目前可分為6個基因型及不同亞型,按照國際通行的方法,以阿拉伯?dāng)?shù)字表示HCV基因型,以小寫的英文字母表示基因亞型(如1b、2a、3b等)。不同HCV基因型感染者的臨床表現(xiàn)、肝病嚴(yán)重程度及慢性化病程進(jìn)展均有差異,抗病毒治療的方案和效果也不同。因此檢測HCV基因型有助于指導(dǎo)判斷治療的難易程度、轉(zhuǎn)歸和制定個體化抗病毒治療方案。
本試劑盒針對HCV-RNA基因組,設(shè)計特異性引物和探針,采用一步法RT-PCR體外擴增法結(jié)合熒光探針檢測技術(shù),檢測中國國內(nèi)人丙型肝炎病毒(HCV)常見基因型別1b、2a、3a、3b和6a。
一步法RT-PCR即逆轉(zhuǎn)錄和PCR在一個共同的體系中進(jìn)行。一步法RT-PCR在處理大量樣品時易于操作,因為在cDNA合成和擴增之間不需要打開管蓋,有助于減少殘余污染,簡化了實驗操作步驟。而且,一步法RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄所得的cDNA全部用于PCR擴增,故可以得到更高的靈敏度。基于以上特點,一步法RT-PCR在臨床檢測應(yīng)用中將有顯著的優(yōu)勢。
熒光PCR技術(shù)在引物特異的基礎(chǔ)上采用模版序列特異的熒光探針從而進(jìn)一步提高的檢測信號的特異性;反應(yīng)中每擴增一個特異產(chǎn)物只釋放一個分子的熒光染料,儀器檢測的是特異擴增的結(jié)果,非特異產(chǎn)物對檢測信號沒有影響,有效提高檢測的專一性。有多種不同波長的熒光基團(tuán)對可供選擇,使得熒光PCR技術(shù)可以實現(xiàn)在同一管內(nèi)檢測多個基因位點,降低成本也提高效率和準(zhǔn)確性。本項目恰好充分利用了熒光PCR技術(shù)的優(yōu)點,針對HCV常見基因型設(shè)計型特異探針,各探針標(biāo)記不同的熒光染料,在不同波長檢測,從而達(dá)到分型的目的。